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肿瘤综合治疗电子杂志
肿瘤综合治疗电子杂志  2021, Vol. 7 Issue (4): 52-57
论著     
基于癌症基因组图谱数据库分析miR-148a-3p在肝细胞癌中的表达和预后意义
郑侠1，姜子瑜2
1．南京中医药大学附属医院　肿瘤内科，南京　210004；2．南京中医药大学附属中西医结合医院　肿瘤内科，南京　210028
 全文: PDF(1189 KB)   1016
摘要： 目的　基于癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas，TCGA）数据库探索miR-148a-3p在肝细胞癌（hepatocellular carcinoma，HCC）中的表达和预后价值。方法　从TCGA数据库HCC数据集中下载患者的临床病理资料和组织标本的微RNA（microRNA，miRNA）测序数据。比较miR-148a-3p在肿瘤组织与癌旁组织中的表达差异，采用受试者操作特征曲线（receiver operating characteristic curve，ROC曲线）评估miR-148a-3p表达对HCC的诊断价值；采用Kaplan-Meier生存分析探讨不同miR-148a-3p表达水平HCC患者的总生存（overall survival，OS）时间和疾病特异生存（disease special survival，DSS）时间；采用单因素和多因素Cox回归分析评估影响HCC患者生存结局的预后因子；采用基因本体论（gene ontology，GO）/京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes，KEGG）富集分析miR-148a-3p的潜在靶基因。结果　共375例HCC患者纳入研究，49例同时检测了肿瘤组织与癌旁组织的miR-148a-3p表达，肿瘤组织miR-148a-3p表达显著低于癌旁组织（16.54∶17.22，P＝0.010）。ROC曲线结果显示，miR-148a-3p表达对HCC具有较好的诊断价值（曲线下面积为0.751，95%CI：0.699～0.804）。Kaplan-Meier分析发现，miR-148a-3p高表达的患者OS时间（104.2个月∶46.2个月，P＝0.001）和DSS时间（104.2个月∶59.7个月，P＝0.026）均更长。多因素Cox回归分析发现，miR-148a-3p高表达是HCC患者良好OS时间的独立预后因子（HR＝0.546，95%CI：0.373～0.799，P＝0.002），但与DSS时间无显著相关性（HR＝1.024，95%CI：0.520～2.014，P＝0.946）。GO/KEGG富集分析发现miR-148a-3p的潜在靶基因富集于FOXO信号通路、转化生长因子-β（transforming growth factor-β，TGF-β）信号通路，与泛素连接复合物、细胞内吞、内皮细胞增殖、细胞周期停滞等功能相关。结论　miR-148a-3p低表达于HCC肿瘤组织，其表达可作为HCC患者生存的可靠预测因子，该分子生物学功能可能参与调控FOXO、TGF-β信号通路，与泛素连接复合物、细胞内吞、内皮细胞增殖、细胞周期停滞等功能相关。
关键词： miR-148a-3p;  肝细胞癌;  预后因子;  癌症基因组图谱数据库    
基金资助: 国家自然学基金面上项目（81973525）
通讯作者: 姜子瑜　E-mail：johnnyfly528@163.com   
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引用本文:

郑侠, 姜子瑜. 基于癌症基因组图谱数据库分析miR-148a-3p在肝细胞癌中的表达和预后意义[J]. 肿瘤综合治疗电子杂志, 2021, 7(4): 52-57.

链接本文:

http://www.jmcm2018.com/CN/10.12151/JMCM.2021.04-10    或    http://www.jmcm2018.com/CN/Y2021/V7/I4/52

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